“小金库”治理工作是一项系统工程，只有纪检、监察、审计、财务、内控、物资、企管等有关部门密切配合，司法机关适时介入，坚持专项清理与日常监管相结合，才能遏制“小金库”现象的泛滥。对治理“小金库”的几点对策和建议如下。
一、强化教育，在思想上杜绝“小金库”。
在日常财务管理监督工作中，针对各单位主要负责人和财务人员，一是要多讲法律政策。教育大家“小金库”是一种典型的利用职务之便，侵吞、窃取国有资产的非法行为，不论“小金库”资金大小，走向如何，是否有贪污、私分痕迹，都是违法行为。“小金库”损害的不光是单位、集体的利益，还有个人的悲欢荣辱。对于单位“一把手”即便自已不搞，但如果放任、甚至纵容“小金库”，仍要承担主要责任。二是用典型警示。经常用一些案例现身说法，深刻剖析思想根源，痛陈“小金库”的危害。让一些单位克服侥幸心理，增强遵纪守法意识。三是开展经常性廉政教育，让单位领导通过学习反思和对照廉政规定进行自我教育，自我约束，增强拒腐防变的能力。
二、制度约束，在体制上制约“小金库”。
通过制度，规范单位财务管理，堵塞管理的漏洞。建立和完善责任追究制度，把“小金库”问题作为党风廉政建设的责任目标之一，明确各部门、各单位“一把手”是第一责任人，一旦发现“小金库”，除了对当事人进行处罚外，还要对相关领导严格按照中纪委关于设立和使用“小金库”款项违纪行为适用《中国共产党纪律处分条例》的解释的规定实行责任追究。
三、常态监督，在管理上严查“小金库”。
一是开展经常性的财务监督和审计监督。同时，推行厂务、政务公开，建立健全一系列公开制度、监督制度，加强职工内部牵制和相互制衡。二是开展定期或不定期地清理“小金库”专项检查活动，把对“小金库”的专项检查活动纳入各项监督的常态管理等，形成多渠道的监督网络。三是不断完善监督检查方法。
四、堵疏结合，从源头上堵住“小金库”。
堵就是要铲除滋生“小金库”的土壤。一是从规范收入上杜绝“小金库”产生。清理收罚项目及标准、清理票据、清理银行账户的“三项基本清理”工作，摸清部门单位各项经费来源渠道和收支规模。二是从支付手段上杜绝“小金库”产生。对专项资金等尽量采用集中支付、直接支付的形式，减少中间环节，增加资金运作过程透明度，完善制约机制，堵塞少数单位私设小金库、曲线转移资金的现象。三是从加强银行账户管理上杜绝“小金库”产生。对现有各类资金专户进行清理归并，切实解决专户开设过多、重复设置的问题。继续加强相关单位银行账户管理，严格执行开户审批及变更备案制度，认真做好单位银行账户年检工作。四是从加强现金管理上杜绝“小金库”产生。实行公务卡结算方式支付招待费、办公费、差旅费等公务支出，统一实行银行卡结算报销，防范和治理”小金库”。五是深化收支两条线管理。对收费和罚没项目要摸清底细，防止私设收费名目和虚假罚款等情况的发生，收入全部实行银行代收代缴，做到收缴分离和罚缴分离。六是加大厂务公开工作力度。充分运用网络实行各种公开，畅通职工群众知情权、参与权的渠道，有利于各利益相关部分互相监督，有效防止资金分配不公或被挪用、截留等问题的发生。“疏”就是实事求是，合情合理地照顾到和解决好单位和职工的具体利益。坚持按劳分配、多劳多得的原则，发的奖金、加班工资、劳务费、补贴等要按制度兑现，不能截留。单位、部门对外交往的招待、交际等费用，在制度许可、手续齐全的前提下，经正常审批流程，核定数额正常列支等等。
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